Статус открытого монастыря получил Спасо-Преображенский Бузулукский мужской монастырь. Соответствующее решение принял Священный синод. Священным архимандритом нового монастыря в Оренбургской области назначен епископ Бузулукский и Сорочинский Алексий, наместником стал игумен Виталий (Климов).

За восстановление Бузулукского Спасо-Преображенского мужского монастыря, образованного в середине XIX века, взялись в начале 2000-х годов. На сегодняшний день удалось восстановить святой источник и часовню над ним, вновь построить храм на пещерах. Освещение храма иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радости» состоялось 5 августа 2012 года. Спасо-Преображенский храм восстановили у стен старинного монастыря, а ныне – женской колонии.

Бузулукский Спасо-Преображенский мужской монастырь был образован к середине XIX века возле Атаманской горы в нескольких километрах от Бузулука. Открытие монастыря в трех верстах от города, утвержденное императором Николаем I и Священным синодом, состоялось 4 октября 1853 года. На тот момент братская община уже насчитывала до 55 человек. Монастырю было выделено 150 десятин земли, озеро Каютино, мельница и т.д. В настоящее время это территория именуется районом воспитательно-трудовой колонии Бузулука. Украшением обители и ее округи были Казанский собор, освященный 13 сентября 1861 года.

С приходом советской власти монастырь действовал под видом сельхозартели. В 1920 году в монастыре числилось 44 монаха и послушника. В 1928 году Средневолжский областной административный отдел расторг договор с монастырем на пользование храмами. В 1929 году монастырь закрыли, на его территории поочередно открылись коммуна, а затем колония для беспризорников. В 1920-1930 годы братия монастыря была подвергнута репрессиям. Предполагается, что пещеры на святом источнике были взорваны.

До 2011 года на исторической территории монастыря действовала исправительная колония для несовершеннолетних, с июня 2011 года – женское исправительное учреждение. До настоящего времени историческая территория монастыря не возвращена Русской Православной Церкви.

За годы советской власти архитектурный комплекс монастыря понес значительные потери. Часть храмов разрушена до основания. Усиленная работа над восстановлением исторических объектов при поддержке бузулучан и благотворителей началась с прибытия в 2012 году на Бузулукскую кафедру епископа Бузулукского и Сорочинского Алексия. Именно по его прошению Священный синод принял решение об открытии Спасо-Преображенского Бузулукского мужского монастыря в Оренбургской области.

Восстановленные святыни Бузулукского Спасо-Преображенского монастыря пользуются почитанием православных жителей Оренбургской области и других регионов России. Бузулучане уже давно считают святые пещеры и часовню на роднике местными достопримечательностями.

Епархиальное управление ведет поиск решений для возвращения исторического комплекса монастыря Русской Православной Церкви.Всех Святых.